Le prieuré Notre-Dame de Vausse, premier issu de l'abbaye du Val-des-Choux, est fondé au XIIIe s. par Anséric VI de Montréal dans ses bois dit de Saint-Jean. Placé sous la protection des seigneurs de Montréal puis des ducs de Bourgogne à partir de 1255, il reçoit de nombreuses donations qui assurent sa prospérité jusqu'au XVe siècle. La mort du dernier duc de Bourgogne en 1477 marque la disparition des protecteurs de l'établissement. Dès le début du XVIe s., les bâtiments conventuels sont en mauvais état ; les donations et les vocations sont plus rares : vers 1550 le prieuré ne compte plus qu'un prieur, cinq moines et deux novices.

En 1745, suite à l'incendie d'une partie des bâtiments conventuels, le prieur prend la décision de faire détruire la salle capitulaire et le dortoir.

Le dernier moine quitte le prieuré en 1763 ; les bâtiments sont laissés à l'abandon.

Dévolution révolutionnaire