Sous l'Ancien Régime la paroisse de Branches dépendait du diocèse de Sens, de la province d'Île-de-France, de l'élection de Joigny et ressortissait au bailliage d'Auxerre. En 1790, érigée en commune, Branches est rattachée au canton de Villemer, puis au district de Joigny en 1793. A partir de 1801, elle appartient au canton d'Aillant-sur-Tholon et à l'arrondissement de Joigny, puis depuis 1926 à celui d'Auxerre.

Dépôts des 22 septembre 1976, 29 juillet 2002 et 22 février 2010.

Archives déposées de la commune de Branches en application de l'article L 212-11 du Code du Patrimoine.