Sous l'Ancien Régime, Pontigny, siège d'une abbaye de l'ordre cistercien, fondée en 1114 et placée sous le vocable de Notre-Dame et Saint-Edme, est succursale de la paroisse de Venouse, dépendant du diocèse d'Auxerre ; une prévôté ressortissant directement au bailliage principal de Sens y est établie. En 1790, érigée en commune, Pontigny est rattachée au canton d'Héry et au district de Saint-Florentin. À partir de 1801, elle est rattachée au canton de Ligny-le-Châtel et à l'arrondissement d'Auxerre.

Dépôts des 24 février 1982, 25 mai 1983 et 15 octobre 2012

Archives déposées de la commune de Pontigny en application de l'article L 212-11 du Code du Patrimoine.