Les différents sinistres et triages expliquent l'importance réduite de ce fonds, en particulier sa pauvreté en actes antérieurs au XIIIe siècle. Il est principalement formé par une collection volumineuse de pièces concernant l'administration des paroisses au XVIIe et XVIIIe siècles et par les titres des domaines de l'évêché à Appoigny, Charbuy, Toucy, Cosne, Sacy et Varzy.
La fondation de l'évêché d'Auxerre remonte au milieu du IIIe siècle ; saint Pèlerin, envoyé par le pape Sixte II, en fut le premier titulaire.
Le diocèse d'Auxerre avait à l'origine les limites que la civitas Autissiodorum ; il comprit jusqu'au Ve siècle tout le Nivernais. Même après que le diocèse de Nevers en eut été démembré au Ve siècle, il s'étendait jusqu'à la Loire, de la Charité à Gien, englobant le Donziois et la Puisaye. Il relevait de la province ecclésiastique de Sens.
Le fonds de l'évêché d'Auxerre a en partie disparu dans l'incendie du château de Régennes, résidence de l'évêque, à l'époque des guerres de Religion. Les triages de 1793 amenèrent à la destruction des titres prétendus féodaux et des terriers.
Classé et coté.
Quantin (Maximilien), Inventaire sommaire des Archives du département de l'Yonne antérieures à 1790, tome II (Archives ecclésiastiques, série G), Auxerre, 1873, p. 283-306.
Perchiot (Jean-Luc), Évêché d'Auxerre : catalogue des documents numérisés, XML, 2013.