À la fin du XIIIe siècle, une synagogue établie au lieu-dit la Souche, sur la paroisse Saint-Regnobert, ayant appartenu aux Juifs expulsés d'Auxerre par Pierre de Courtenay, est convertie par l'évêque Hugues de Noyers en un hôpital dirigé par les religieux de Saint-Antoine. À une date inconnue, il est transféré au quartier Saint-Antoine.
Archives réunies au fonds de l'hôtel-Dieu d'Auxerre et déposées aux archives départementales en 1915.
Drot (M.), Inventaire sommaire des archives départementales de l'Yonne antérieures à 1790, archives hospitalières, série H supplément, p. 196.