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Pour intervenir dans les meilleures conditions sur une empreinte endommagée, il est essentiel d'en connaître la structure.
Des techniques médicales peuvent venir en appui de l'observation externe des sceaux : grâce à la radiographie et au scanner permettant une modélisation en 3 dimensions (tomographie), il est possible "d'entrer dans la matière" et d'en comprendre l'organisation (qualité des cires et des colorants, passage des attaches, étapes de fabrication d'une empreinte).
Des pièces d'apport peuvent alors être confectionnées sur mesure, qui viennent s'emboîter dans l'espace laissé libre par une importante lacune.