Parallèlement à l'introduction de substances venues du Nouveau Monde, la chimie de laboratoire progresse avec la préparation de remèdes nouveaux.

Les recherches menées au cours du XVIIIe s. et du début du XIXe s. participent à l'isolement des principes actifs contenus dans chaque plante (composant à effet thérapeutique présent parfois en très petite quantité).

Désormais, les simples, les principes actifs et leurs dérivés cohabitent dans les pharmacies hospitalières.