L'usage des engrais chimiques, pourtant promu par les autorités, peine à s'imposer dans l'Yonne.

En 1862, le ministère de l'Agriculture décide de mener une grande enquête : sous couvert du préfet, une lettre et un questionnaire sont envoyés à toutes les communes du département. Dans les réponses transparaît une certaine méfiance envers les engrais non traditionnels : on utilise encore beaucoup de fumier de ferme, d'engrais végétal ou de guano.

Dans l'enquête de 1899 apparaît encore l'attachement aux engrais « de ferme », malgré les succès du nitrate de soude (ou nitrate du Chili).